Dzimis un audzis Madonā.

1951. gadā absolvējis Madonas 1. vidusskolu.

1957. gadā absolvēja Rīgas Medicīnas institūtu, bet darba gaitas sāka Alojas slimnīcā Ķirurģijas nodaļas vadītāja amatā.

1963.–1969. gadā strādāja Republikas bērnu klīniskajā slimnīcā par Ķirurģiskās nodaļas vadītāju. 1969. gadā aizstāvēja medicīnas zinātņu doktora disertāciju.

1972. gadā kļuva par Rīgas Medicīnas institūta Bērnu ķirurģijas katedras profesoru. 1998. gada prof. Gaujēnam piešķirts valsts emeritētā zinātnieka tituls.

Par lielo ieguldījumu Latvijas bērnu ķirurģijas attīstībā un jauno speciālistu bērnu ķirurģijā sagatavošanā 2009. gadā Paula Stradiņa Medicīnas vēstures muzejs un LZA viņam piešķīra Paula Stradiņa balvu.