Savu profesionālā spēlētāja karjeru Mareks uzsāka 1998. gadā, spēlējot Čehijas Ekstralīgas klubā Triņecas "Ocelari". "Ocelari" rindās Jans spēlēja līdz pat 2003. gadam. 2003. gada NHL draftā Mareku izvēlējās Ņujorkas "Rangers", taču savā tālākajā karjerā Mareks uz Ziemeļameriku nedevās.

2003.—04. sezonā Mareks uzsāka spēlēt Prāgas "Sparta" rindās. 2005.—06. sezonā, spēlējot "Sparta" sastāvā, Mareks kļuva par Čehijasčempionu, taču jau nākamajā sezonā viņš kļuva par Krievijas čempionu, aizvadot savu pirmo sezonu Magņitogorskas "Metallurg" rindās. 

2008.—09. sezonā tika atzīts par KHL oktobra labāko uzbrucēju, kā arī bija otrs rezultatīvākais regulārās sezonas spēlētājs. Ar 35 gūtiem vārtiem viņš bija arī otrs labākais līgas vārtu guvējs. 2009. gada 10. janvārī Mareks spēlēja Pirmajā KHL Zvaigžņu spēlē, kurā guva vienus vārtus, kā arī atdeva vienu rezultatīvu piespēli. Pēc 2009.—10. sezonas noslēguma Mareks pievienojās Maskavas CSKA vienībai, taču, tuvojoties regulārās sezonas noslēgumam, bija skaidrs, ka CSKA izslēgšanas kārtai nekvalificēsies, tādēļ Mareks līgumu ar Maskavas klubu lauza, pievienojoties Mitišču "Atlant" sastāvam.

Čehijas hokeja izlases rindās spēlējis 2007., 2009., 2010. un 2011. gada Pasaules čempionātos, 2010. gadā izcīnot Pasaules čempiona titulu, bet 2011. gadā kopā ar izlasi izcīnot bronzas medaļas.

2011.gadā pievienojās Jaroslavļas "Lokomotiv" klubam.  7.septembris viņam un komandas biedriem kļuva par liktenīgo.

Avots: http://www.ceskenoviny.cz, Vikipēdija