Dzimis 1886. gada 30. jūlijā.

Mācās Aknīstes, Ilūkstes skolās. Noliek lauku skolotāja eksāmenu.

Neilgu laiku strādājis par skolotāja palīgu netālu no Talsiem. No 1904. gada skolotājs Eķengrāves (vēlāk Viesītes) pagasta skolā.

Jau Ilūkstē iepazinies ar marksismu un jaunstrāvnieku idejām. 1904.g. kļūst par LSDSP biedru.

1906.g.arestēts, ieslodzīts Jēkabpils cietumā. Kļūdas dēļ izlaists. Slapstoties turpina revolucionāro drabību, darbojas pagrīdes tipogrāfijās.

1907.g.notverts. Pie J.Krastiņa tiek atrastas sprāgstvielas. Notiesāts uz diviem gadiem cietumā.

Pēc atbrīvošanas noliek ģimnāzijas eksāmenus. Iestājas Sanktpēterburgas Universitātes juridiskajā fakultātē. pelna iztiku kā mājskolotājs.

1911.g.laulības ar skolotāju Nadježdu Miloslavu. 

Pēc universitātes beigšanas kļūst par Pētera Stučkas palīgu viņa advokatūras kantorī Sanktpēterburgā. Kopā nostrādā 3 gadus - līdz 1916.g. J.Krastiņu iesauc cara armijā. Nosūtīts uz karaskolu, pēc kuras piekomandēts Rietumu artilērijas divīzijai Lugā.

Februāra revolūcijas laikā ievēlēts par deputātu Pirmajā Petrogradas padomē, taču pavasarī tiek nosūtīts uz fronti. 1917.g.nokļūst gūstā un tiek nosūtīts uz Vāciju. Atbrīvots 1918. g.decembrī.

Atgriežas Petrogradā. Mobilizēts Sarkanajā armijā. Karēlijas kauju iecirkņa štāba priekšnieka palīgs politdarbā, tad 55.strēlnieku divīzijas artilērijas štāba komisārs. Tiek piekomandēts Petrogradas kara apgabala tribunālam. Piedalījies Kronštates sacelšanās likvidēšanā.

Ieņem dažādus kara juridiskos amatus.

1922.g.beidz attiecības ar militāro sfēru. Kļūst par Petrogradas guberņas prokuroru.

Kopš 1923.g.māca studentiem kriminālistiku.

1928.g.Maskava, nodaļas vadītājs Krievijas Federācijas prokuratūrā.

1930.g. Irkutska, Austrumsibīrijas novada prokurors.

1934.g.atgriežas Maskavā. Atsāk kriminālistikas pasniegšanu.

No 1935.g. līdz nāvei Vissavienības tiesību akadēmijas rektors.

1938. gadā savā dzīvoklī Maskavā izdarīja pašnāvību, nošaujoties. Nākamajā dienā pasludināts par tautas ienaidnieku, dzīvoklī veikta kratīšna.

Urna ar J.Krastiņa pelniem iemūrēta Maskavas Donas klostera sienā netālu no krematorijas.